PCR儀的測序反應試驗講解
點擊次數(shù):1420 更新時間:2021-07-23
PCR儀進行測序反應試驗時應按照步驟依次進行:
1.取0.2ml的PCR管,用記號筆編號,將管插在顆粒冰中,加入規(guī)定試劑。總反應體積5μl,不加輕礦物油或石蠟油,蓋緊PCR管,用手指彈管混勻,稍離心。將PCR管置于PCR儀上進行擴增。98℃變性2min后進行PCR循環(huán),PCR循環(huán)參數(shù)為96℃10秒,50℃5秒,60℃4分鐘,25個循環(huán),擴增結束后設置4℃保溫。
醋酸鈉/乙醇法純化PCR產(chǎn)物:
1.將混合物離心,將擴增產(chǎn)物轉移到1.5ml EP管中;
2.加入25μl醋酸鈉/乙醇混合液,充分振蕩,置冰上10min以沉淀DNA。12000r/min于4℃離心30min,小心棄上清;
3.加70%(V/V)的乙醇50μl洗滌沉淀2次。12000r/min于4℃離心5min,小心棄上清和管壁的液珠,真空干燥沉淀10-15min。
電泳前測序PCR產(chǎn)物的處理:
1.加入12μl的TSR于離心管中,劇烈振蕩,讓其充分溶解DNA沉淀,稍離心;
2.將溶液轉移至蓋體分離的0.2ml PCR管中,稍離心;
3.在PCR儀上進行熱變性(95℃2min),冰中驟冷,待上機。
具體上機操作按PCR儀說明書安裝毛細管,進行毛細管位置的校正,人工手動灌膠和建立運行的測序順序文件。儀器將自動灌膠至毛細管,1.2kV預電泳5min,按編程次序自動進樣,再預電泳(1.2kV,20min),在7.5kV下電泳2h。電泳結束后儀器會自動清洗,灌膠,進下一樣品,預電泳和電泳。每一個樣品電泳總時間為2.5h。電泳結束后儀器會自動分析或打印出彩色測序圖譜。
儀器將自動進行序列分析,并可根據(jù)用戶要求進行序列比較。如測序序列已知,可通過序列比較以星號標出差異堿基處,提高工作效率。
測序完畢按PCR儀操作規(guī)程進行儀器清洗與保養(yǎng)。
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